Przejdź do głównej treści

Widok zawartości stron Widok zawartości stron

Aktualności

Wydarzenia | Konferencje | Grupy badawcze | Publikacje

Widok zawartości stron Widok zawartości stron

Global City Sampling Day 2024: Nowe Gatunki w Mikrobiologicznym Odcisku Palca Krakowa?

Global City Sampling Day 2024: Nowe Gatunki w Mikrobiologicznym Odcisku Palca Krakowa?

Czy biletomaty i ławki na przystankach tramwajowych mogą być równie bogate biologicznie jak lasy deszczowe? Aby odpowiedzieć na to pytanie naukowcy z całego świata zagłębią się w świat mikroorganizmów, badając powierzchnie transportu publicznego podczas corocznej akcji Global City Sampling Day (gCSD). Kraków, już po raz czwarty, dołącza do tej globalnej inicjatywy.

Próbki zbierane z przystanków i tramwajów

gCSD to doroczny projekt, w którym w tym samym dniu na całym świecie naukowcy, badacze, studenci i inni przeszkoleni obywatele wyruszają w przestrzeń miejską w celu zebrania próbek środowiskowych. gCSD odbędzie się 21 czerwca w ponad 60 miastach na sześciu kontynentach. Kraków przyłączył się do tej inicjatywy w 2020 roku, gdy wolontariusze pobierali wymazy z przystanków i tramwajów na trasach linii 52, 50 i 14. Dodatkowe próbki zostały pobrane za pomocą próbnika powietrza w tunelach znajdujących się w okolicach Dworca Głównego. W tym roku akcja zostanie powtórzona, a dr hab. inż. Paweł Łabaj, prof. UJ i jego zespół z Małopolskiego Centrum Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego zaprezentują „mikrobiologiczny odcisk palca” Krakowa. Dzięki tym danym lepiej zrozumiemy, jak mikroorganizmy wpływają na nasze życie w mieście. Zebrane próbki trafią do bazy MetaSUB w Nowym Jorku, gdzie zespół prof. Christophera Masona zsekwencjonuje DNA z każdej próbki.

gCSD na Świecie

gCSD to inicjatywa MetaSUB International Consortium. Dr hab. inż. Paweł Łabaj, krajowy koordynator MetaSUB i współzałożyciel MetaSUB Europe, jest głównym organizatorem gCSD w Krakowie. Kraków to pierwsze miasto w Polsce biorące udział w akcji obok kilkudziesięciu innych takich jak Nowy Jork, Berlin, Hong Kong, Tokio czy Buenos Aires. Razem od 2015 roku zespoły badaczy i wolontariuszy na całym świecie zebrały tysiące próbek w ponad 60 miastach. Z całą historią MetaSUB można zapoznać się tutaj

Mapy środowiskowe miast 

W ciągu ostatnich kilku lat praca badawcza konsorcjum MetaSUB pokazała między innymi specyficzność gatunkową niektórych obszarów miast, w tym pozwoliła na wykrycie nowych społeczności i składników środowiska. Wyniki badań wskazują na mikrobiologiczną skalę zdarzeń środowiskowych i mają aplikowalność w kryminalistyce oraz w oznaczaniu obecności szczepów/patogenów lekoopornych. W maju 2021 konsorcjum opublikowało wyniki pierwszych lat gCSD w magazynie Cell. Znaleziono 4,246 znanych gatunków mikroorganizmów we wszystkich zebranych próbkach. Bakterie stanowiły dwie trzecie z tych znalezisk, pozostałe to mieszanka grzybów, wirusów i innych mikrobów. Dodatkowo odkryto 10,928 wcześniej nieudokumentowanych wirusów oraz 748 nowych rodzajów bakterii. Eksperci zauważają, że większość z tych organizmów jest prawdopodobnie neutralna dla ludzi, a niektóre mogą być nawet korzystne. Nowe wirusy prawdopodobnie są bakteriofagami, które infekują bakterie. Odkryte mikroby mogą potencjalnie wspierać rozwój nowych terapii, leków czy pomagać w rekultywacji zanieczyszczonych obszarów.

Kraków w gCSD 2020

Projekt nie byłby możliwy bez wsparcia Wydziału ds. Przedsiębiorczości i Innowacji Urzędu Miasta Krakowa, Zarządu Transportu Publicznego, Miejskiego Przedsiębiorstwa Komunikacyjnego i Straży Miejskiej.

 

 

 

 

 

 

 

Mapa lokalizacji pobierania próbek - miejsca pobrania próbek z powietrza w tunelach w pobliżu Dworca Głównego (mapa ciepła)

 

 

 

 

 

 

 

"Promienista" mapa pokazująca względną liczebność każdego gatunku w przykładowej próbce. Źródło MetaSUB

Polecamy również
Gdzie udawać urydynę?

Gdzie udawać urydynę?

Dr hab. Sebastian Glatt z MCB członkiem Europejskiej Organizacji Biologii Molekularnej

Dr hab. Sebastian Glatt z MCB członkiem Europejskiej Organizacji Biologii Molekularnej

Rola mikrobiomu jelitowego w przebiegu COVID-19: nowe spojrzenie na diagnostykę i prognostykę

Rola mikrobiomu jelitowego w przebiegu COVID-19: nowe spojrzenie na diagnostykę i prognostykę

The Doctoral School of Exact and Natural Sciences has announced the winners of the 2024 Excellence Module competition

The Doctoral School of Exact and Natural Sciences has announced the winners of the 2024 Excellence Module competition