Moje zainteresowania badawcze obejmują rozwój metodologii do eksploracji danych i ich zastosowanie w aktualnych wyzwaniach biomedycznych, ze szczególnym uwzględnieniem rozwoju analizy danych w transkryptomice i metagenomice w kontekście medycyny precyzyjnej. W związku z tym pełnię wiodącą rolę w konsorcjum SEQC koordynowanym przez U.S. Food and Drug Administration (FDA), którego celem jest benchmarking technologii profilowania ekspresji genów na dużą skalę, w tym RNA-Seq. Obecnie, w ramach drugiej fazy SEQC badam komplementarność celowanego RNA-Seq i sekwencjonowania genomowego dla zaawansowanej diagnostyki nowotworów. Jestem również wiodącym członkiem Międzynarodowego Konsorcjum MetaSUB, gdzie skupiam się na definiowaniu podejść do analizy w metagenomice środowiskowej w kontekście zdrowia i dobrostanuy mieszkańców, jak również na umożliwieniu wykorzystania analizy mikrobiomu środowiskowego do celów kryminalistycznych.